in silico biology, inc.

Shop and Corporate Information Site

サイト内全文検索

eShop in silico サブスクリプションライセンス製品

1年以内の期間限定ライセンスを使用される方向けのサブスクリプション製品です(ログイン前:消費税抜き価格、ログイン後:日本消費税込)。
3ヶ月 IMC GE 3ヶ月
IMC GE 3ヶ月 ¥16,500 税抜価格: ¥15,000
12ヶ月 IMC GE 12ヶ月
IMC GE 12ヶ月 ¥39,600 税抜価格: ¥36,000
6ヶ月 IMC GE 6ヶ月
IMC GE 6ヶ月 ¥26,400 税抜価格: ¥24,000

eShop in silico 製品カテゴリ

代謝モデル解析ソフトウェア製品

特別注文製品です。汎用製品ではありません。

販売価格についてはお見積りいたします。

MLD_MPVE MetabolicPathwayVisualizer

生物種別の任意の代謝パスウェイを生成し、可視化するソフトウェアです。

 

機能概要

  • ゲノムスケールモデルのロード機能
  • 注釈付きゲノム配列データのロード機能
  • 代謝パスウェイ描画機能
    • サブシステム別ローカルパスウェイ描画機能
    • 指定した化合物からのパスウェイ伸長
    • 複数のローカルパスウェイを1個のパスウェイに合成する機能
    • 指定した2つの化合物閑の最短パスウェイを検索し、パスウェイ上にルート表示する機能
  • 代謝パスウェイ印刷機能(描画したパスウェイをpng形式で画像出力します)

使用データ形式

  • ゲノムスケールモデルデータ形式: XML, Matlab, CSV
  • 注釈付きゲノム情報ファイル形式: GenBank

ソフトウェアの動作環境

  • 動作OS: MacOS 11, 12, 13 および Windows 11
  • 動作Platform: MATLAB (2022b 以降)

納品形式

  • データファイルはUSBメモリーに格納され、納品されます。また、データが更新された場合はダウンロードサービスがあります。

MLD_GPRA GPRAnnotator

ゲノムスケールモデルと注釈付きゲノム配列データから、GPR:GeneProductRelationを自動あるいは手動で注釈付けするソフトウェアです。

 

機能概要

  • ゲノムスケールモデルのロード機能
  • 注釈付きゲノム配列データのロード機能
  • ゲノムスケールモデルのReaction情報に対するのGeneProductAssociation関連注釈の解析機能
  • 対応する生物種のゲノム情報におけるgene注釈との自動リンク機能
  • 複雑なGeneProductAssociationルールを可視化した論理図に変換する機能
  • ゲノムスケールモデルに注釈されたgene情報のIDと対応するゲノム背哲情報が対応しない場合に、相同性検索によりIDを対応化する機能

使用データ形式

  • ゲノムスケールモデルデータ形式: XML, Matlab, CSV
  • 注釈付きゲノム情報データ形式: GenBank

ソフトウェアの動作環境

  • 動作OS: MacOS 11, 12, 13 および Windows 11
  • 動作Platform: MATLAB (2022b 以降)

納品形式

  • データファイルはUSBメモリーに格納され、納品されます。また、データが更新された場合はダウンロードサービスがあります。

MSW-MSCT MetabolicStreamChainTracer

代謝反応連鎖トレースツールです。

目的化合物までの生体内反応連鎖をトレースします。

反応連鎖データベースを独自生成しているため、導入後すぐに使用できます。

動作環境

  • 動作OS: MacOSX.15以降 および Windows 10以降
  • 動作Platform: MATLAB (2022a 以降) (MATLAB は納品されません。別途入手いただきます)

機能概要

  • 必要データ自動インストール機能
  • 反応連鎖データベース生成機能
  • 反応連鎖データインポート機能
  • 加脱分子による反応連鎖トレース機能

付属データ

  • 反応連鎖データベース
  • 生体内代謝物データ
  • 生体反応データ
  • 加脱分子データ

納品形式

  • プログラム・スクリプトファイルはDVDに格納され、納品されます。ダウンロードも可能です。

MSW-SVCG MetabolicStreamViewer for Corynebacterium

Corynebacterium用の代謝ストリームビューアです。

サブシステム別に代謝ストリームを表示編集できます。

代謝物座標データが付属しているため、使用開始時点でも見やすい代謝ストリームを表示できます。

動作環境

  • 動作OS: MacOSX.15以降 および Windows 10以降
  • 動作Platform: MATLAB (2021b 以降) (MATLAB は納品されません。別途入手いただきます)

機能概要

  • ゲノムスケールモデル入力機能
  • 代謝ストリームの表示および編集機能
  • 代謝解析データ・代謝実験データのオーバーレイ表示機能
  • サブシステム別代謝ストリームの比較機能

付属データ形式

  • 代謝物座標データ(XLS形式)
  • 他にMap形式の補助データがあります。

納品形式

  • プログラム・スクリプトファイルはDVDに格納され、納品されます。

代謝モデル解析ソフトウェア製品

特注ソフトウェア製品

利用者のニーズに応じたカスタマイズ可能なソフトウェア製品です。

GenomeScaleModel Design Checker

 製品番号 枝番 製品名称  納期  価格
 MLC-DC BK  GSM Design Checker 2営業日  見積いたします

 

GenomeScaleModel Handlers

 製品番号 枝番 製品名称  納期  価格
 MLC-GS EC  GSModel Handler EC 1週間  見積いたします
 MLC-GS CG  GSModel Handler CG 1週間  見積いたします
 MLC-GS AF  GSModel Handler AF 1週間  見積いたします

 

GenomeScaleModel Analyzers

 製品番号 枝番 製品名称  納期  価格
 MLC-MA BK  GSModel Analyzer Base Kit 1週間  見積いたします
 MLC-MA EX  GSModel Analyzer Extention 1週間  見積いたします

 

GenomeScaleModel Creator / Generator

 製品番号 枝番 製品名称  納期  価格
 MLC-MC BS  GSModel Creator  BS 1週間  見積いたします
 MLC-MG RM  GSModelGeneratorRM 1週間  見積いたします
 MLC-MG UM  GSModelGeneratorUM 1週間  見積いたします

 

MetaModeller & MetaModelComparator

 製品番号 枝番 製品名称  納期  価格
 MLC-MM AN  MetaModeller Analysis Kit 1週間  見積いたします
 MLC-MM CR  MetaModeller Creation Kit 1週間  見積いたします
 MLC-MM CP  MetaModelComparator 1週間  見積いたします

 

 FBA Executers

 製品番号 枝番 製品名称  納期  価格
 MLC-FB EC  FBA Executer EC 1週間  見積いたします
 MLC-FB CG  FBA Executer CG 1週間  見積いたします
 MLC-FB AF  FBA Executer AF 1週間  見積いたします

 

KnockOut Executers

 製品番号 枝番 製品名称  納期  価格
 MLC-OK EC  KnockOut Executer EC 1週間  見積いたします
 MLC-OK PP  KnockOut Executer PP 1週間  見積いたします
 MLC-OK AF  KnockOut Executer YL 1週間  見積いたします
 MLC-OK SS  KnockOut Executer SS 1週間  見積いたします
 MLC-OK ME  KnockOut Executer ME 1週間  見積いたします
 MLC-OK AF  KnockOut Executer AF 1週間  見積いたします

代謝モデル関連製品

代謝モデル用辞書

代謝モデル解析に使える辞書類です。代謝モデル解析用にチューニングされています。

Metabolite Dictionary

 製品番号 枝番 製品名称  納期  価格
 MDC-ME TE  Metabolite Dictionary Tuning Edition 2営業日  見積いたします

 

Reaction Dictionary

 製品番号 枝番 製品名称  納期  価格
 MDC-RX TE  Reaction Dictionary Tuning Edition 2営業日  見積いたします

 

 生物種別 ゲノムスケールモデル構築・解析用データ

GSM Data Sets for Species

 製品番号 枝番 製品名称  納期  価格
 MDC-GS EC  GSM DataSet for Escherichia coli  5営業日  見積いたします
 MDC-GS SC  GSM DataSet for Saccharomyces cerevisiae  7営業日  見積いたします
 MDC-GS AO  GSM DataSet for Aspergillus oryaze 10営業日  見積いたします

 

代謝反応自動分類ソフトウェア

ReactionClassifier

 製品番号 枝番 製品名称  納期  価格
 MDC-RX CL  ReactionClassifier  5営業日  見積いたします

 

 

酵素関連データベース

酵素の反応物・生成物に関するデータベース製品

EnzymeReactantProductDB

 製品番号 枝番 製品名称  納期  価格
 DBEZ REPR  EnzymeReactantProductDB 3営業日  見積いたします

 

 

ゲノムスケール代謝モデル製品

ゲノムスケールモデル製品

オリジナルMET ID, REACTION ID を任意のIDに変換した製品です。

Bacteria

 製品番号 枝番 製品名称  納期  価格
 MGS-BC EC  Escherichia sp. 3営業日  見積いたします
 MGS-BC CB  Corynebacterium sp. 3営業日  見積いたします

 

Fungi 

 製品番号 枝番 製品名称  納期  価格
 MGS-FG SC  Saccharomyces sp.  5営業日  見積いたします
 MGS-FG AO  Aspergillus oryzae 5営業日  見積いたします
 MGS-FG TD  Trichoderma sp. 5営業日  見積いたします

 

 

代謝ストリームワークベンチ特注製品

代謝ストリームワークベンチ関連製品

代謝ストリームワークベンチ上で動作する個別特注製品です。

 

生物種別代謝ストリームビューア

MetabolicStreamViewer

 製品番号 枝番 製品名称  納期  価格
 MSW-SV EC  MetabolicStreamViewer for Escherichia coli 3営業日  見積いたします
 MSW-SV CG  MetabolicStreamViewer for Corynebacterium glutamicum 3営業日  見積いたします
 MSW-SV SC  MetabolicStreamViewer for Saccharomyces cerevisiae 近日リリース予定  

 

代謝ストリームファインダー

MetabolicStreamFinder

 製品番号 枝番 製品名称  納期  価格
 MSW-SF BE  MetabolicStreamFinder Basic Edition 10営業日  見積いたします

 

 

SureServer for SAKURA(EV)

選択中のライセンスに対応する試用版

ご購入の前に試用ライセンスで動作確認ができます(廉価版のIMCEE, IMCSEには試用ライセンスはありません)