既定フィーチャーキー
フィーチャーキーの登録、編集、削除
テンプレート機能
フィーチャーキー検索
Feature Keyの種類
属性
IMCが独自に設定しているフィーチャーキーを説明します。
これらのフィーチャーキーを一括取り除く機能もあります。
Qualifierの種類と役割について説明します。
GenBank / EMBL / DDBJの国際塩基配列データベースの規約において、Qualifierの使用規則が定められていますが、IMCでは独自のQualifierをも追加して、有用な機能を実現しています。IMCが独自のQualfierを設定している理由は、GenBank / EMBL ファイルに直接制御データを記述し、利用者が配列ファイルの取り扱いが簡単になるためです。
上記規約で取り決められたQualifier
IMCが独自に追加したQualifier
/genomemap=
/new=
/update=
Featureの属性を示すQualifierの表示方法や編集方法に関する情報を提供しています。
以下はFeatureに記述されているQualfierの値の表示方法を２つを表しています。
ゲノム配列上におけるフィーチャーの位置にかんする説明。
制限酵素やPCR増幅によるフィーチャーの断片化について説明します。
PCRやライゲーションによるフィーチャーの合成を説明します。
フィーチャーフュージョン機能は、2つの同一positionにある同一Feature Keyに属するフィーチャーを1つに融合する機能です。融合されるそれぞれのフィーチャーに記録されていたQualifierは融合されたフィーチャーのQualifierとしてどちら側のQualifierも同等に保持されます。
この機能により、同一のフィーチャーに対して別々に付けられた複数のアノテーションを簡単に1つにまとめることができます。
フィーチャー演算子は、同一Feature Keyに属する２つの互いにオーバーラップするフィーチャーの論理演算を行い、新たなフィーチャーを生成する機能です。
上下がオーバーラップするフィーチャーで、中央が演算生成されたフィーチャー。
個々のフィーチャーにリンクし、その可視化ツールを起動できるのは以下のものがあります。
分子立体構造ファイルとその可視化ツール、
文献ファイル（pdf)とPDF表示ツール
個々のフィーチャーへのマッピング
フィーチャーに連番を付加することができます。
具体的には、連番を付加する対象のフィーチャーのQualifierの一つに連番を付ける編集操作になります。
対象となるフィーチャーや連番を付けるQualifierはある程度自由に選択できます。
複数の配列ファイルにまたがって連番をつける機能もあります。
また、検索の結果絞り込まれたフィーチャーに連番を付加することも可能です。
