クローニング
IMCは、クローニング実験の操作をコンピュータ上で実行できることに特徴があります。この際、特殊なデータは不要で、GenBankやEMBLなどの公的なデータベースから入手できる塩基配列データをそのままクローニングすることが可能です。クローニングは注釈付の配列をそのまま、制限酵素消化、PCRプライマー設計、PCR増幅、ライゲーションを実行できます。結果として得られるクローニング生産物はすべてGenBank/EMBLフォーマットで出力されます。Primer情報は塩基配列上に貼り付けられ保存されるるため、Primerの管理にも有用です。
- 実際に切断・ライゲーションできるクローニング機能です。
- インシリコのクローニング実験が可能です。
- 目に見えない分子生物学実験を理解する助けになります。 分子生物学実験の補助やシミュレーションに使用できます。
- 任意のVector/Plasmidをコンストラクトできます。
- Vectorへのインサートチェックに最適な制限酵素をリストアップし、そのゲル電気泳動結果をシミュレート表示します。
- 制限酵素処理(制限酵素地図、制限酵素消化断片生成、インサートチェックに最適な制限酵素候補リスト、その他)
- PCRプライマー設計、
- 特定のフィーチャー上を避けるプライマー設計、
- PCRによる複製(注釈含む)、
- 全遺伝子を増幅する一括プライマー設計、
- プライマー管理 ライゲーション、セルフライゲーション、
- 塩基断片末端形状適合性チェック
- プラスミドマップ作成(インサート領域吹出機能) (レイアウトスタイル対応)
- 注釈を記述したままのクローニング DNA末端への制限酵素認識部位の付加
- DNA末端平滑化(Blunting)、リン酸化(脱リン酸化
- 注釈付き塩基配列の任意領域切り出し